Vattenkvaliteten i Östersjön mäts med många indikatorer
Östersjöns vattenkvalitet övervakas regelbundet på många olika sätt. Flera statliga forskningsinstitut deltar också i mätningarna. Resultaten av vattenkvalitetsmätningar baserar sig på övervakning och satellitobservationer både i öppna havsområden och i kustvatten.
Parametrarna för vattenkvalitet är temperatur, salthalt, syrehalt, algmängd, siktdjup, grumlighet, kväve och fosfor.
Vattenkvaliteten undersöks genom att ta vattenprover på observationsstationer. Förutom proverna används fjärrkartering, som ger observationer av större områden.